Oregon Therapeutics et Lantern Pharma collaborent dans le domaine de l’IA pour optimiser le développement du XCE853

Lantern Pharma, société leader dans la découverte et le développement de médicaments en oncologie grâce à l’intelligence artificielle (IA), a annoncé aujourd’hui une collaboration stratégique basée sur l’IA avec la société de biotechnologie française Oregon Therapeutics afin d’optimiser le développement de son candidat médicament XCE853, premier inhibiteur de la protéine disulfide isomérase (PDI) (1), dans des indications nouvelles et ciblées contre le cancer.

Lantern utilisera sa plateforme d’IA propriétaire RADR® pour découvrir des biomarqueurs et des signatures génétiques associées à l’efficacité du XCE853 dans les tumeurs solides. Ces travaux devraient permettre d’identifier des biomarqueurs qui pourront être utilisés pour stratifier les tumeurs les plus sensibles au XCE853 et guider le développement clinique et la sélection des patients. Oregon Therapeutics développe le XCE853 dans plusieurs indications en oncologie, notamment les cancers de l’ovaire et du pancréas, certains cancers hématologiques et plusieurs cancers pédiatriques, y compris en neuro-oncologie.

Les PDI sont des cibles prometteuses pour le traitement du cancer, qui ont récemment suscité un fort intérêt clinique 2, en raison de leur potentiel dans les cancers de mauvais pronostic comme le cancer du sein 3 ou le cancer de l’ovaire. Plusieurs études cliniques ont démontré que l’augmentation de l’expression des PDI était associée à une mortalité accrue dans des cancers tels que le carcinome hépatocellulaire (4), ainsi que les cancers du sein et de l’ovaire (5). Les PDI sont des protéines chaperonnes qui jouent un rôle central dans le métabolisme des cellules cancéreuses. Les inhibiteurs de PDI peuvent entraîner la mort des cellules cancéreuses par l’accumulation de protéines altérées et la dysrégulation des réponses au stress cellulaire. La combinaison de ces effets est connue sous le nom de protéotoxicité, une stratégie thérapeutique unique et prometteuse qui pourrait être particulièrement efficace pour cibler les cancers résistants à certains médicaments de référence en oncologie.

Aux États-Unis, près de 612 000 personnes (6) vont mourir d’un cancer en 2024 et la résistance aux médicaments anticancéreux sera impliquée dans 90 % de ces décès (7). À ce jour, aucun inhibiteur de PDI n’a atteint le stade clinique en raison de la complexité liée à la sélection et à la cartographie des molécules qui vont cibler plus précisément les enzymes PDI adéquates. Il existe plus de 20 enzymes PDI, chacune jouant un rôle légèrement différent et souvent redondant sur le plan biologique. Le principal candidat médicament d’Oregon Therapeutics – le XCE853 – est connu pour cibler les PDI ayant un rôle spécifique en oncologie. Lantern Pharma et Oregon Therapeutics estiment que les outils informatiques – y compris les modèles fondamentaux, l’apprentissage automatique et l’analyse moléculaire à grande échelle – peuvent offrir une voie idéale et simplifiée pour analyser et comprendre la complexité de ces données, faisant de RADR® la plateforme parfaite pouvant délivrer les informations clés sur le rôle que le candidat médicament XCE853 peut jouer dans le traitement efficace du cancer. (8, 9)

« À ce jour, notre premier inhibiteur métabolique, le XCE853, a démontré une efficacité préclinique robuste dans les modèles in-vitro et in-vivo de nombreux types de cancers», déclare Marc-Henry PITTY, Président d’Oregon Therapeutics. « La plateforme d’IA RADR® de Lantern exploitera nos données in-vitro et in-vivo pour faire avancer le développement du XCE853 de manière très ciblée, et contribuera à apporter des informations clés sur les meilleures indications possibles en oncologie, les signatures de biomarqueurs qui peuvent aider à la conception des essais cliniques, ainsi qu’à la mise au point de thérapies combinées avec d’autres médicaments pour le traitement du cancer. Notre équipe est impatiente de pouvoir sélectionner efficacement les options de développement idéales et de réduire les risques liés aux futures décisions de développement clinique. » Oregon Therapeutics a déjà effectué des études précliniques démontrant qu’en plus des cancers de l’ovaire et du pancréas, le XCE853 pourrait également être particulièrement actif dans les cancers du rein, de la prostate, du poumon, du sein, de la sphère ORL, ainsi que dans la leucémie.

Sandrine Courtès, responsable projet chez Oregon, ayant développé la collaboration avec Lantern Pharma, déclare : « Les inhibiteurs de PDI ont un grand potentiel, car cette cible moléculaire est fortement exprimée dans plusieurs types de cancer, favorise la croissance tumorale et est significativement corrélée aux résultats cliniques. »

Cette collaboration portera principalement sur l’intégration et l’analyse des données moléculaires, génétiques et transcriptomiques relatives au XCE853. L’analyse sera alimentée par RADR® et sa bibliothèque croissante de plus de 60 milliards de points de données provenant de divers types de mesures biologiques et d’expériences en oncologie, ainsi que par plus de 200 algorithmes ML axés sur des problèmes qui sont – dans la réalité – au cœur des challenges liés au développement des médicaments anticancéreux. Les objectifs initiaux de la collaboration sont les suivants :

1) découvrir des biomarqueurs et des signatures génétiques associées à l’efficacité du XCE853, afin de guider la stratification et la sélection des patients pour de futurs essais cliniques,

2) identifier les mécanismes de résistance aux traitements et de réponse des tumeurs au XCE853 et les stratégies pour surmonter ces mécanismes de résistance, et

3) étendre l’utilisation du XCE853 à d’autres indications thérapeutiques en oncologie pour le XCE853.

« Les équipes de développement de médicaments se sont heurtées à d’importantes difficultés en matière de données et de modélisation pour faire face aux complexités associées aux inhibiteurs de PDI, compte-tenu des défis liés à la création de modèles pertinents, à l’accumulation et au déchiffrement des données », déclare Panna Sharma, président-directeur général de Lantern Pharma. « Notre plateforme d’IA, RADR®, peut accroître la confiance, les connaissances et les niveaux de confort dans l’élaboration de voies de développement fondées sur les données précliniques, cela en modélisant des scénarios très complexes à une échelle qui n’est devenue possible que récemment. C’est une approche idéale pour Oregon Therapeutics, qui a réalisé une série d’expériences in vivo et in vitro très ciblées et qui est prête à prendre des décisions incroyablement importantes et centrées sur le patient concernant l’avenir clinique de la molécule. C’est là que RADR® peut jouer un rôle essentiel et déterminant pour répondre aux besoins du marché. »

Selon les termes de la collaboration, Lantern Pharma reçoit une part égale de propriété intellectuelle et des droits de développement de médicaments pour les biomarqueurs nouvellement découverts, les nouvelles indications et/ou les nouvelles stratégies d’utilisation pharmacologique pour le XCE853 et les analogues apparentés. Oregon Therapeutics percevra les revenus liés à l’octroi à Lantern Pharma d’une licence d’exploitation de ses brevets. Enfin, Lantern Pharma et Oregon Therapeutics partageront les revenus financiers supplémentaires résultant de l’octroi à un tiers d’une licence sur la propriété intellectuelle de la collaboration. Aucun autre détail financier concernant la collaboration n’a été divulgué.

Références

1. Prevost G.P. et al. Abstract 3760: XCE853 is a promising protein disulfide isomerase (PDI) inhibitor exhibiting a strong inhibitory activity in preclinical tumor models. Cancer Res. (2016) 76 (14_Supplement): 3760. https://doi.org/10.1158/1538-7445.AM2016-3760
2. Shili Xu, Saranya Sankar, Nouri Neamati, Protein disulfide isomerase: a promising target for cancer therapy, Drug Discovery Today, Volume 19, Issue 3, 2014, Pages 222-240, ISSN 1359-6446, https://doi.org/10.1016/j.drudis.2013.10.017. (https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S135964461300384X)
3. Powell LE, Foster PA. Protein disulfide isomerase inhibition as a potential cancer therapeutic strategy. Cancer Med. 2021 Apr;10(8):2812-2825. doi: 10.1002/cam4.3836. Epub 2021 Mar 20. PMID: 33742523; PMCID: PMC8026947.
4. Yu, Won et al. 2014, Korean J Intern Med 29(5): 580-587), brain tumors (Zou et al. 2018, Oncol Rep. Feb;39(2):501-510.)
5. Samanta et al. 2017, Oncotarget. Nov 28; 8(61): 103543–103556
6. Siegel R.L., Giaquinto A.N., and Jemal A. Cancer statistics 2024. CA: A Cancer Journal for Clinicians. (Jan/Feb 2024) 74 (1): 12-49. https://doi.org/10.3322/caac.21820
7. Longley D.B. and Johnston P.G. Molecular mechanisms of drug resistance. The Journal of Pathology. (Jan 2005) 205 (2): 275-292. https://doi.org/10.1002/path.1706
8. Rutkevich L.A., Cohen-Doyle M.F., Brockmeier U., Williams D.B. (2010). Molecular Biology of the Cell. 21:3093–105. https://doi.org/10.1091/mbc.e10-04-0356
9. Watanabe M.W., Laurindo, F.R.M, Fernandes, D.C. Frontiers in Chemistry. (2014). Methods of measuring protein disulfide isomerase activity: a critical overview. 2, 73. https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fchem.2014.00073/full

Source : Oregon Therapeutics / Lantern Pharma